甲流和普通感冒在儿童身上引发的并发症长期危害存在差异，涉及呼吸系统、心血管系统、神经系统、免疫系统及生长发育等方面。
1、呼吸系统：甲流引发的并发症对呼吸系统长期危害更严重。甲流可能导致儿童出现病毒性肺炎，即便治愈后，肺部也可能留下纤维化等后遗症，影响肺功能，使孩子在日后运动或劳累时更容易出现气短、呼吸困难等症状。普通感冒引发的支气管炎等并发症，大多可完全恢复，对肺功能长期影响较小。
2、心血管系统：甲流病毒可能侵犯心肌，引发心肌炎。儿童患甲流后，若并发心肌炎，即使急性期治愈，也可能存在心律失常等潜在问题，影响心脏的正常功能和结构，增加未来患心血管疾病的风险。普通感冒较少累及心血管系统，即便偶有并发心肌损伤，程度通常也较轻，恢复后对心血管系统长期危害不大。
3、神经系统：甲流可引起神经系统并发症，如脑炎、脑膜炎等。这些并发症可能导致儿童智力发育迟缓、癫痫发作等长期问题，影响孩子的学习和生活能力。普通感冒引发神经系统并发症的概率极低，即便出现，症状也相对较轻，对神经系统的长期影响有限。
4、免疫系统：甲流感染可能对儿童免疫系统造成较大冲击，使免疫系统在一段时间内处于紊乱状态，导致孩子在后续一段时间内容易反复感染其他疾病。普通感冒对免疫系统的影响相对较小，免疫系统可较快恢复正常。
5、生长发育：由于甲流并发症导致儿童身体不适、营养摄入不足等情况，可能会影响孩子的生长发育。如长期的呼吸系统问题导致孩子缺氧，影响身体各器官的正常发育。普通感冒一般不会对生长发育产生明显的长期影响。
综上所述，甲流和普通感冒在儿童并发症的长期危害上存在明显差异，甲流引发的并发症长期危害通常更严重、更广泛。因此，在甲流流行季节，应积极做好预防措施，一旦孩子出现疑似甲流症状，需及时就医治疗，以降低并发症的发生风险及其长期危害。
