甲流和普通感冒对心脏功能及运动耐力的影响受病毒特性、炎症反应程度、心肌损伤情况、病程长短、并发症等因素影响。一般而言，甲流对心脏功能影响更大，更易导致运动耐力下降。
1、病毒特性：甲流由甲型流感病毒引起，该病毒传染性强、变异性大，侵袭力也较强。相比之下，普通感冒多由鼻病毒、冠状病毒等引起，这些病毒毒力相对较弱，对身体整体影响较小。
2、炎症反应程度：感染甲流后，免疫系统会产生强烈的免疫反应，引发全身炎症反应综合征。这种过度的炎症反应可能波及心脏，导致心肌细胞受损。而普通感冒引发的炎症反应通常较局限，程度也相对较轻，对心脏的影响较小。
3、心肌损伤情况：甲流病毒有可能直接侵犯心肌，引起病毒性心肌炎。病毒性心肌炎会影响心肌的正常收缩和舒张功能，导致心脏泵血功能下降，进而影响运动耐力。普通感冒引发心肌损伤的概率较低，即便出现，症状也相对较轻。
4、病程长短：甲流的病程一般较长，患者可能在较长时间内处于发热、乏力等不适状态，身体消耗较大。长时间的不适会使心脏负担加重，影响心脏功能恢复，导致运动耐力下降。普通感冒病程较短，身体恢复较快，对心脏功能和运动耐力的影响也相对短暂。
5、并发症：甲流容易引发多种并发症，如肺炎、呼吸衰竭等。这些并发症会进一步加重身体负担，影响心脏功能。严重时可能导致心力衰竭，使运动耐力明显下降。普通感冒并发症相对较少，对心脏功能的间接影响也较小。
6、治疗药物影响：治疗甲流时，部分药物可能存在一定的心脏毒性，在治疗过程中可能会对心脏功能产生一定影响。而治疗普通感冒的药物副作用相对较少，对心脏功能的影响也相对较小。
综上所述，甲流由于病毒特性、炎症反应、心肌损伤、病程及并发症等多方面因素，通常对心脏功能影响更大，更容易导致运动耐力下降。但具体情况因人而异，无论感染甲流还是普通感冒，若出现心悸、胸闷等心脏不适症状，都应及时就医，在医生指导下进行治疗和康复。
